অ্যালিল (Allele) হলো একই জিনের দুটি ভিন্ন বা বিকল্প রূপ। সহজভাবে বললে, একটি জিন আমাদের শরীরের যে বৈশিষ্ট্য নিয়ন্ত্রণ করে (যেমন: চোখের রঙ), সেই বৈশিষ্ট্যের যে আলাদা আলাদা সংস্করণ থাকতে পারে, তাদেরকেই অ্যালিল বলা হয়।
একটি নির্দিষ্ট জিনের অ্যালিলগুলো ক্রোমোজোমের একই স্থানে বা লোকাসে অবস্থান করে।